特性总览
PolarDB for PostgreSQL(以下简称 PolarDB)是一款阿里云自主研发的企业级数据库产品,采用计算存储分离架构,100% 兼容 PostgreSQL。PolarDB 的存储与计算能力均可横向扩展,具有高可靠、高可用、弹性扩展等企业级数据库特性。同时,PolarDB 具有大规模并行计算能力,可以应对 OLTP 与 OLAP 混合负载;还具有时空、向量、搜索、图谱等多模创新特性,可以满足企业对数据处理日新月异的新需求。
PolarDB 支持多种部署形态:存储计算分离部署、X-Paxos 三节点部署、本地盘部署。
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传统数据库的问题
随着用户业务数据量越来越大,业务越来越复杂,传统数据库系统面临巨大挑战,如:
- 存储空间无法超过单机上限。
- 通过只读实例进行读扩展,每个只读实例独享一份存储,成本增加。
- 随着数据量增加,创建只读实例的耗时增加。
- 主备延迟高。
PolarDB 云原生数据库的优势
针对上述传统数据库的问题,阿里云研发了 PolarDB 云原生数据库。采用了自主研发的计算集群和存储集群分离的架构。具备如下优势:
- 扩展性:存储计算分离,极致弹性。
- 成本:共享一份数据,存储成本低。
- 易用性:一写多读,透明读写分离。
- 可靠性:三副本、秒级备份。
PolarDB 整体架构概述
下面会从两个方面来解读 PolarDB 的架构,分别是:存储计算分离架构、HTAP 架构。
存储计算分离架构概述
PolarDB 是存储计算分离的设计,存储集群和计算集群可以分别独立扩展:
- 当计算能力不够时,可以单独扩展计算集群。
- 当存储容量不够时,可以单独扩展存储集群。
基于 Shared-Storage 后,主节点和多个只读节点共享一份存储数据,主节点刷脏不能再像传统的刷脏方式了,否则:
- 只读节点去存储中读取的页面,可能是比较老的版本,不符合他自己的状态。
- 只读节点指读取到的页面比自身内存中想要的数据要超前。
- 主节点切换到只读节点时,只读节点接管数据更新时,存储中的页面可能是旧的,需要读取日志重新对脏页的恢复。
对于第一个问题,我们需要有页面多版本能力;对于第二个问题,我们需要主库控制脏页的刷脏速度。
HTAP 架构概述
读写分离后,单个计算节点无法发挥出存储侧大 IO 带宽的优势,也无法通过增加计算资源来加速大的查询。我们研发了基于 Shared-Storage 的 MPP 分布式并行执行,来加速在 OLTP 场景下 OLAP 查询。 PolarDB 支持一套 OLTP 场景型的数据在如下两种计算引擎下使用:
- 单机执行引擎:处理高并发的 OLTP 型负载。
- 分布式执行引擎:处理大查询的 OLAP 型负载。
在使用相同的硬件资源时性能达到了传统 MPP 数据库的 90%,同时具备了 SQL 级别的弹性:在计算能力不足时,可随时增加参与 OLAP 分析查询的 CPU,而数据无需重分布。
PolarDB:存储计算分离架构详解
Shared-Storage 带来的挑战
基于 Shared-Storage 之后,数据库由传统的 share nothing,转变成了 shared storage 架构。需要解决如下问题:
- 数据一致性:由原来的 N 份计算+N 份存储,转变成了 N 份计算+1 份存储。
- 读写分离:如何基于新架构做到低延迟的复制。
- 高可用:如何 Recovery 和 Failover。
- IO 模型:如何从 Buffer-IO 向 Direct-IO 优化。
架构原理
首先来看下基于 Shared-Storage 的 PolarDB 的架构原理。
- 主节点为可读可写节点(RW),只读节点为只读(RO)。
- Shared-Storage 层,只有主节点能写入,因此主节点和只读节点能看到一致的落盘的数据。
- 只读节点的内存状态是通过回放 WAL 保持和主节点同步的。
- 主节点的 WAL 日志写到 Shared-Storage,仅复制 WAL 的 meta 给只读节点。
- 只读节点从 Shared-Storage 上读取 WAL 并回放。
数据一致性
传统数据库的内存状态同步
传统 share nothing 的数据库,主节点和只读节点都有自己的内存和存储,只需要从主节点复制 WAL 日志到只读节点,并在只读节点上依次回放日志即可,这也是复制状态机的基本原理。
基于 Shared-Storage 的内存状态同步
前面讲到过存储计算分离后,Shared-Storage 上读取到的页面是一致的,内存状态是通过从 Shared-Storage 上读取最新的 WAL 并回放得来,如下图:
- 主节点通过刷脏把版本 200 写入到 Shared-Storage。
- 只读节点基于版本 100,并回放日志得到 200。
基于 Shared-Storage 的“过去页面”
上述流程中,只读节点中基于日志回放出来的页面会被淘汰掉,此后需要再次从存储上读取页面,会出现读取的页面是之前的老页面,称为“过去页面”。如下图:
- T1 时刻,主节点在 T1 时刻写入日志 LSN=200,把页面 P1 的内容从 500 更新到 600;
- 只读节点此时页面 P1 的内容是 500;
- T2 时刻,主节点将日志 200 的 meta 信息发送给只读节点,只读节点得知存在新的日志;
- T3 时刻,此时在只读节点上读取页面 P1,需要读取页面 P1 和 LSN=200 的日志,进行一次回放,得到 P1 的最新内容为 600;
- T4 时刻,只读节点上由于 BufferPool 不足,将回放出来的最新页面 P1 淘汰掉;
- 主节点没有将最新的页面 P1 为 600 的最新内容刷脏到 Shared-Storage 上;
- T5 时刻,再次从只读节点上发起读取 P1 操作,由于内存中已把 P1 淘汰掉了,因此从 Shared-Storage 上读取,此时读取到了“过去页面”的内容;
“过去页面” 的解法
只读节点在任意时刻读取页面时,需要找到对应的 Base 页面和对应起点的日志,依次回放。如下图:
- 在只读节点内存中维护每个 Page 对应的日志 meta。
- 在读取时一个 Page 时,按需逐个应用日志直到期望的 Page 版本。
- 应用日志时,通过日志的 meta 从 Shared-Storage 上读取。
通过上述分析,需要维护每个 Page 到日志的“倒排”索引,而只读节点的内存是有限的,因此这个 Page 到日志的索引需要持久化,PolarDB 设计了一个可持久化的索引结构 - LogIndex。LogIndex 本质是一个可持久化的 hash 数据结构。
- 只读节点通过 WAL receiver 接收从主节点过来的 WAL meta 信息。
- WAL meta 记录该条日志修改了哪些 Page。
- 将该条 WAL meta 插入到 LogIndex 中,key 是 PageID,value 是 LSN。
- 一条 WAL 日志可能更新了多个 Page(索引分裂),在 LogIndex 对有多条记录。
- 同时在 BufferPool 中给该该 Page 打上 outdate 标记,以便使得下次读取的时候从 LogIndex 重回放对应的日志。
- 当内存达到一定阈值时,LogIndex 异步将内存中的 hash 刷到盘上。
通过 LogIndex 解决了刷脏依赖“过去页面”的问题,也是得只读节点的回放转变成了 Lazy 的回放:只需要回放日志的 meta 信息即可。
基于 Shared-Storage 的“未来页面”
在存储计算分离后,刷脏依赖还存在“未来页面”的问题。如下图所示:
- T1 时刻,主节点对 P1 更新了 2 次,产生了 2 条日志,此时主节点和只读节点上页面 P1 的内容都是 500。
- T2 时刻, 发送日志 LSN=200 给只读节点。
- T3 时刻,只读节点回放 LSN=200 的日志,得到 P1 的内容为 600,此时只读节点日志回放到了 200,后面的 LSN=300 的日志对他来说还不存在。
- T4 时刻,主节点刷脏,将 P1 最新的内容 700 刷到了 Shared-Storage 上,同时只读节点上 BufferPool 淘汰掉了页面 P1。
- T5 时刻,只读节点再次读取页面 P1,由于 BufferPool 中不存在 P1,因此从共享内存上读取了最新的 P1,但是只读节点并没有回放 LSN=300 的日志,读取到了一个对他来说超前的“未来页面”。
- “未来页面”的问题是:部分页面是未来页面,部分页面是正常的页面,会到时数据不一致,比如索引分裂成 2 个 Page 后,一个读取到了正常的 Page,另一个读取到了“未来页面”,B+Tree 的索引结构会被破坏。
“未来页面”的解法
“未来页面”的原因是主节点刷脏的速度超过了任一只读节点的回放速度(虽然只读节点的 Lazy 回放已经很快了)。因此,解法就是对主节点刷脏进度时做控制:不能超过最慢的只读节点的回放位点。如下图所示:
- 只读节点回放到 T4 位点。
- 主节点在刷脏时,对所有脏页按照 LSN 排序,仅刷在 T4 之前的脏页(包括 T4),之后的脏页不刷。
- 其中,T4 的 LSN 位点称为“一致性位点”。
低延迟复制
传统流复制的问题
- 同步链路:日志同步路径 IO 多,网络传输量大。
- 页面回放:读取和 Buffer 修改慢(IO 密集型 + CPU 密集型)。
- DDL 回放:修改文件时需要对修改的文件加锁,而加锁的过程容易被阻塞,导致 DDL 慢。
- 快照更新:RO 高并发引起事务快照更新慢。
如下图所示:
- 主节点写入 WAL 日志到单机文件系统中。
- WAL Sender 进程读取,并发送。
- 只读节点的 WAL Receiver 进程接收写入到单机文件系统中。
- 回放进程读取 WAL 日志,读取对应的 Page 到 BufferPool 中,并在内存中回放。
- 主节点刷脏页到 Shared Storage。
可以看到,整个链路是很长的,只读节点延迟高,影响用户业务读写分离负载均衡。
优化 1:只复制 Meta
因为底层是 Shared-Storage,只读节点可直接从 Shared-Storage 上读取所需要的 WAL 数据。因此主节点只把 WAL 日志的元数据(去掉 Payload)复制到只读节点,这样网络传输量小,减少关键路径上的 IO。如下图所示:
- WAL Record 是由:Header,PageID,Payload 组成。
- 由于只读节点可以直接读取 Shared-Storage 上的 WAL 文件,因此主节点只把 WAL 日志的元数据发送(复制)到只读节点,包括:Header,PageID。
- 在只读节点上,通过 WAL 的元数据直接读取 Shared-Storage 上完整的 WAL 文件。
通过上述优化,能显著减少主节点和只读节点间的网络传输量。从下图可以看到网络传输量减少了 98%。
优化 2:页面回放优化
在传统 DB 中日志回放的过程中会读取大量的 Page 并逐个日志 Apply,然后落盘。该流程在用户读 IO 的关键路径上,借助存储计算分离可以做到:如果只读节点上 Page 不在 BufferPool 中,不产生任何 IO,仅仅记录 LogIndex 即可。
可以将回放进程中的如下 IO 操作 offload 到 session 进程中:
- 数据页 IO 开销。
- 日志 apply 开销。
- 基于 LogIndex 页面的多版本回放。
如下图所示,在只读节点上的回放进程中,在 Apply 一条 WAL 的 meta 时:
- 如果对应 Page 不在内存中,仅仅记录 LogIndex。
- 如果对应的 Page 在内存中,则标记为 Outdate,并记录 LogIndex,回放过程完成。
- 用户 session 进程在读取 Page 时,读取正确的 Page 到 BufferPool 中,并通过 LogIndex 来回放相应的日志。
- 可以看到,主要的 IO 操作有原来的单个回放进程 offload 到了多个用户进程。
通过上述优化,能显著减少回放的延迟,比 AWS Aurora 快 30 倍。
优化 3:DDL 锁回放优化
在主节点执行 DDL 时,比如:drop table,需要在所有节点上都对表上排他锁,这样能保证表文件不会在只读节点上读取时被主节点删除掉了(因为文件在 Shared-Storage 上只有一份)。在所有只读节点上对表上排他锁是通过 WAL 复制到所有的只读节点,只读节点回放 DDL 锁来完成。而回放进程在回放 DDL 锁时,对表上锁可能会阻塞很久,因此可以通过把 DDL 锁也 offload 到其他进程上来优化回放进程的关键路径。
通过上述优化,能够回放进程一直处于平滑的状态,不会因为去等 DDL 而阻塞了回放的关键路径。
上述 3 个优化之后,极大的降低了复制延迟,能够带来如下优势:
- 读写分离:负载均衡,更接近 Oracle RAC 使用体验。
- 高可用:加速 HA 流程。
- 稳定性:最小化未来页的数量,可以写更少或者无需写页面快照。
Recovery 优化
背景
数据库 OOM、Crash 等场景恢复时间长,本质上是日志回放慢,在共享存储 Direct-IO 模型下问题更加突出。
Lazy Recovery
前面讲到过通过 LogIndex 我们在只读节点上做到了 Lazy 的回放,那么在主节点重启后的 recovery 过程中,本质也是在回放日志,那么我们可以借助 Lazy 回放来加速 recovery 的过程:
- 从 checkpoint 点开始逐条去读 WAL 日志。
- 回放完 LogIndex 日志后,即认为回放完成。
- recovery 完成,开始提供服务。
- 真正的回放被 offload 到了重启之后进来的 session 进程中。
优化之后(回放 500MB 日志量):
Persistent BufferPool
上述方案优化了在 recovery 的重启速度,但是在重启之后,session 进程通过读取 WAL 日志来回放想要的 page。表现就是在 recovery 之后会有短暂的响应慢的问题。优化的办法为在数据库重启时 BufferPool 并不销毁,如下图所示:crash 和 restart 期间 BufferPool 不销毁。
内核中的共享内存分成 2 部分:
- 全局结构,ProcArray 等。
- BufferPool 结构;其中 BufferPool 通过具名共享内存来分配,在进程重启后仍然有效。而全局结构在进程重启后需要重新初始化。
而 BufferPool 中并不是所有的 Page 都是可以复用的,比如:在重启前,某进程对 Page 上 X 锁,随后 crash 了,该 X 锁就没有进程来释放了。因此,在 crash 和 restart 之后需要把所有的 BufferPool 遍历一遍,剔除掉不能被复用的 Page。另外,BufferPool 的回收依赖 k8s。该优化之后,使得重启前后性能平稳。
PolarDB:HTAP 架构详解
PolarDB 读写分离后,由于底层是存储池,理论上 IO 吞吐是无限大的。而大查询只能在单个计算节点上执行,单个计算节点的 CPU/MEM/IO 是有限的,因此单个计算节点无法发挥出存储侧的大 IO 带宽的优势,也无法通过增加计算资源来加速大的查询。我们研发了基于 Shared-Storage 的 MPP 分布式并行执行,来加速在 OLTP 场景下 OLAP 查询。
HTAP 架构原理
PolarDB 底层存储在不同节点上是共享的,因此不能直接像传统 MPP 一样去扫描表。我们在原来单机执行引擎上支持了 MPP 分布式并行执行,同时对 Shared-Storage 进行了优化。 基于 Shared-Storage 的 MPP 是业界首创,它的原理是:
- Shuffle 算子屏蔽数据分布。
- ParallelScan 算子屏蔽共享存储。
如图所示:
- 表 A 和表 B 做 join,并做聚合。
- 共享存储中的表仍然是单个表,并没有做物理上的分区。
- 重新设计 4 类扫描算子,使之在扫描共享存储上的表时能够分片扫描,形成 virtual partition。
分布式优化器
基于社区的 GPORCA 优化器扩展了能感知共享存储特性的 Transformation Rules。使得能够探索共享存储下特有的 Plan 空间,比如:对于一个表在 PolarDB 中既可以全量的扫描,也可以分区域扫描,这个是和传统 MPP 的本质区别。图中,上面灰色部分是 PolarDB 内核与 GPORCA 优化器的适配部分。下半部分是 ORCA 内核,灰色模块是我们在 ORCA 内核中对共享存储特性所做的扩展。
算子并行化
PolarDB 中有 4 类算子需要并行化,下面介绍一个具有代表性的 Seqscan 的算子的并行化。为了最大限度的利用存储的大 IO 带宽,在顺序扫描时,按照 4MB 为单位做逻辑切分,将 IO 尽量打散到不同的盘上,达到所有的盘同时提供读服务的效果。这样做还有一个优势,就是每个只读节点只扫描部分表文件,那么最终能缓存的表大小是所有只读节点的 BufferPool 总和。
下面的图表中:
- 增加只读节点,扫描性能线性提升 30 倍。
- 打开 Buffer 时,扫描从 37 分钟降到 3.75 秒。
消除数据倾斜问题
倾斜是传统 MPP 固有的问题:
- 在 PolarDB 中,大对象的是通过 heap 表关联 TOAST 表,无论对哪个表切分都无法达到均衡。
- 另外,不同只读节点的事务、buffer、网络、IO 负载抖动。
以上两点会导致分布执行时存在长尾进程。
- 协调节点内部分成 DataThread 和 ControlThread。
- DataThread 负责收集汇总元组。
- ControlThread 负责控制每个扫描算子的扫描进度。
- 扫描快的工作进程能多扫描逻辑的数据切片。
- 过程中需要考虑 Buffer 的亲和性。
需要注意的是:尽管是动态分配,尽量维护 buffer 的亲和性;另外,每个算子的上下文存储在 worker 的私有内存中,Coordinator 不存储具体表的信息;
下面表格中,当出现大对象时,静态切分出现数据倾斜,而动态扫描仍然能够线性提升。
SQL 级别弹性扩展
那我们利用数据共享的特点,还可以支持云原生下极致弹性的要求:把 Coordinator 全链路上各个模块所需要的外部依赖存在共享存储上,同时 worker 全链路上需要的运行时参数通过控制链路从 Coordinator 同步过来,使 Coordinator 和 worker 无状态化。
因此:
- SQL 连接的任意只读节点都可以成为 Coordinator 节点,这解决了 Coordinator 单点问题。
- 一个 SQL 能在任意节点上启动任意 worker 数目,达到算力能 SQL 级别弹性扩展,也允许业务有更多的调度策略:不同业务域同时跑在不同的节点集合上。
事务一致性
多个计算节点数据一致性通过等待回放和 globalsnapshot 机制来完成。等待回放保证所有 worker 能看到所需要的数据版本,而 globalsnapshot 保证了选出一个统一的版本。
TPC-H 性能:加速比
我们使用 1TB 的 TPC-H 进行了测试,首先对比了 PolarDB 新的分布式并行和单机并行的性能:有 3 个 SQL 提速 60 倍,19 个 SQL 提速 10 倍以上;
另外,使用分布式执行引擎测,试增加 CPU 时的性能,可以看到,从 16 核和 128 核时性能线性提升;单看 22 条 SQL,通过该增加 CPU,每个条 SQL 性能线性提升。
TPC-H 性能:和传统 MPP 数据库的对比
与传统 MPP 数据库相比,同样使用 16 个节点,PolarDB 的性能是传统 MPP 数据库的 90%。
前面讲到我们给 PolarDB 的分布式引擎做到了弹性扩展,数据不需要充分重分布,当 dop = 8 时,性能是传统 MPP 数据库的 5.6 倍。
分布式执行加速索引创建
OLTP 业务中会建大量的索引,经分析建索引过程中:80%是在排序和构建索引页,20%在写索引页。通过使用分布式并行来加速排序过程,同时流水化批量写入。
上述优化能够使得创建索引有 4~5 倍的提升。
分布式并行执行加速多模:时空数据库
PolarDB 是对多模数据库,支持时空数据。时空数据库是计算密集型和 IO 密集型,可以借助分布式执行来加速。我们针对共享存储开发了扫描共享 RTREE 索引的功能。
- 数据量:40000 万,500 GB
- 规格:5 个只读节点,每个节点规格为 16 核 CPU、128 GB 内存
- 性能:
- 随 CPU 数目线性提升
- 共 80 核 CPU 时,提升71 倍
总结
本文从架构层面分析了 PolarDB 的技术要点:
- 存储计算分离架构。
- HTAP 架构。
后续文章将具体讨论更多的技术细节,比如:如何基于 Shared-Storage 的查询优化器,LogIndex 如何做到高性能,如何闪回到任意时间点,如何在 Shared-Storage 上支持 MPP,如何和 X-Paxos 结合构建高可用等等,敬请期待。